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目前無證據顯示自體免疫疾病患者不能接受那一種特定的疫苗。
風濕病藥物調整:大部分的風濕病藥物(免疫調節藥物)並不影響疫苗的施打，但仍有部分藥物的使用者須調整施打疫苗的時間，以產生較好的免疫保護反應。請與您的醫師討論。
對於患有心臟疾病的病人，由於可能為感染後重症高危險群，因此強烈建議要打疫苗。若有服用抗血小板藥物或抗凝血劑，此並非施打疫苗的禁忌症。但施打後建議加壓施打處5~10分鐘以上，並確認是否止血或有血腫。建議可心臟科醫師討論。
針對顯影劑過敏部分:由於莫德納(Moderna)疫苗中的佐劑成分：TROMETAMOL曾經有報告指出與核磁共振(MRI)的顯影劑(gadolinium based contrast agent = GBCA)、電腦斷層含碘顯影劑(Ultravist、Omnipaque、Iopamiro、Isovue、Visipaque、Xenetix、Optiray)的賦形劑相關，但台灣及美國CDC皆未列於禁忌症中，因此建議若有已知對TROMETAMOL或MRI顯影劑(GBCAs)、電腦斷層含碘顯影劑過敏的人，不建議施打莫德納(Moderna)疫苗。